Sinan Özer, Mithat Özer ve Beyza Özer'in oğludur. Ayşe Özer adında bir kız kardeşi bulunmaktadır. 1981 yılında ünlü sanatçı Sezen Aksu ile dünyaevine girmiştir. Bu evlilikten Mithat Can Özer adında bir oğlu dünyaya gelmiştir. Çift, 1983 yılında yollarını ayırmıştır. Sinan Özer'in Sinan Can Özer adında bir oğlu daha bulunmaktadır. Ailesiyle olan ilişkileri, özellikle oğlu Mithat Can Özer ile olan bağı kamuoyunda zaman zaman yer almıştır. Babası Mithat Özer, 2015 yılında Bodrum'da vefat etmiştir. Aile üyeleri, Bodrum'daki iş ve sosyal çevreleriyle tanınmaktadır. Özel hayatını gizli tutmayı tercih eden bir yapısı vardır.

Sinan Özer'in kökeni hakkında spesifik bir memleket bilgisi kamuoyuna yansımamıştır. İş hayatını ağırlıklı olarak Ege Bölgesi'nde, özellikle Bodrum ve çevresinde sürdürmüştür. Türk yatçılığının duayenlerinden biri olarak kabul edilmektedir. Eğitimini Boğaziçi Üniversitesi'nde tamamlamıştır. Gençlik yıllarından itibaren denizcilik ve turizm sektörüne yönelmiştir. Türkiye'nin turizm potansiyelini uluslararası platformlarda tanıtmak için büyük çaba sarf etmiştir. Ailesi, Bodrum'un yerleşik ve tanınan ailelerinden biri olarak bilinmektedir. İş dünyasındaki faaliyetleri, Türkiye'nin turizm ve denizcilik tarihinin bir parçası olarak değerlendirilmektedir.

Sinan Özer'in aşk hayatı, özellikle Sezen Aksu ile olan evliliği nedeniyle uzun yıllar magazin gündeminde yer almıştır. 10 Temmuz 1981 tarihinde Sezen Aksu ile evlenmiş, bu evlilik 1983 yılında sona ermiştir. Bu birliktelik, Türk pop müziğinin en ikonik isimlerinden biriyle olan bağı nedeniyle her zaman merak konusu olmuştur. Boşanmalarına rağmen, oğulları Mithat Can Özer üzerinden iletişimlerini sürdürmüşlerdir. Sezen Aksu, Sinan Özer'den sonraki dönemlerde de ailevi bağların önemine vurgu yapmıştır. Sinan Özer, Sezen Aksu ile olan evliliği dışında özel hayatını medyadan tamamen uzak tutmuştur. Evlilik sonrası dönemde herhangi bir evlilik veya kamuoyuna yansıyan ciddi bir ilişki bilgisi bulunmamaktadır. Aşk hayatı, genellikle Sezen Aksu ile olan geçmişi üzerinden hatırlanmaktadır.

Sinan Özer, iş dünyasında tanınan, özellikle yatçılık ve turizm sektöründeki girişimleriyle bilinen bir isimdir. Boğaziçi Üniversitesi İş İdaresi bölümünden mezun olmuştur. Kariyerine tekstil sektöründe başlayıp, kısa sürede denizcilik tutkusuyla yatçılık sektörüne geçiş yapmıştır. Sezen Aksu ile olan evliliği, onun kamuoyunda daha geniş kitlelerce tanınmasını sağlamıştır. Mithat Can Özer'in babasıdır. Hayatını Bodrum merkezli olarak sürdürmüş ve bölgenin turizm gelişimine katkıda bulunmuştur. Medyadan uzak, iş odaklı bir yaşam tarzını benimsemiştir. 2015 yılında babası Mithat Özer'i kaybetmiştir. Hakkında çok az kişisel bilgi bulunması, onun özel hayatına verdiği önemi göstermektedir. Türk iş dünyasında, özellikle Ege Bölgesi'nde saygın bir yere sahiptir. Yaşamı, girişimcilik ve deniz tutkusunun birleştiği bir başarı hikayesi olarak tanımlanabilir.